Zellen-Elektrophysiologie-Simulations-Umgebung (CESE) ist ein kompletter Rahmen, der spezifisch konzipiert, um elektrophysiologische rechnerischsimulationen z.B. Simulationen durchzuführen der elektrischen Aktivität der Herzmuskelzelle.

Zellen-Elektrophysiologie-Simulations-Umgebung ist für Simulationen der Aktionspotentiale, des einzelnen Ionenbargeldes und der Änderungen in den Ionenkonzentrationen nützlich.

CESE ist ein Kreuzplattform Programm, läuft es auf jedes mögliches System, das Java-Ablaufumgebungsversion (JRE) 1.4 oder oben hat. Es geprüft auf Windows, Linux, Solarisen, Mac Os X und AIX.

CESE Benutzer

CESE ist eine integrierte Umgebung für die Ausführung von Computersimulationen using eine Vielzahl der elektrophysiologischen Baumuster.

Gegenwärtig erlaubt CESE Kreation und Ausführung der einzelligen Baumuster (Hodgkin-Huxley und (HH) Markovsche aktuelle Formulierungen enthalten). Baumuster der elektrischen Aktivität der Herzmuskelzellen mit Quellencode eingeschlossen in der CESE Verteilung n. Wir hoffen, die Zahl erhältlichen Baumustern auszudehnen und hinzufügen bestimmte neuronale Baumuster zukünftig ftig.

Die Hauptstärke von CESE ist in seinem Gleichförmigkeit �, das eine Programmschnittstelle die selbe für verschiedene Typen der Baumuster bleibt. Sie können zwischen Baumuster leicht schalten und Simulationsausgänge vergleichen. Vorbildliche Parameter können für Ausgang geändert werden, festgelegt werden und/oder in den selben festgeklemmt werden, Standardmethode.

CESE ausdehnt die herkömmliche elektrophysiologische Bedeutung der „Spannungsrohrschelle“. Sie können praktisch jede vorbildliche Variable, einschließlich Spannung (Membranenpotential) festklemmen, Gesamt- oder einzelnes Ionenbargeld, Ionenkonzentrationen, Temperatur, mit einem Gatter versehende Variablen, usw. Die festklemmenden Befehle können komplizierte Funktionen stückweise sein, einstellten einzeln für die Baumustervariable von Zinsen. Dieses öffnet endlose Möglichkeiten für die Exploration des komplizierten vorbildlichen Verhaltens.

CESE liefert die einfachen, aber effizienten Datensichtbarmachungen. Simulationsresultate können in der Graphik und in den Tabellierformen dargestellt werden. Pläne können angepaßt werden und Regionen von Zinsen laut summten.

Selbst wenn CESE nicht konzipiert, um ein Datenanalysewerkzeug zu sein, können Sie I/V-Verhältnisse festlegen (Ich-Gegen) und statistische Parameter für ein gegebenes Signal innerhalb des Programms berechnen. Sie können Ihre Daten in ASCII, Neurit-Textdatei- (ATF) und NetCDFformate exportieren, um Analyse in Ihrem Lieblingspaket fortzusetzen.

CESE Entwickler

CESE erstellt vom Boden enthalten bis die beste programmierenpraxis, die für Java-Entwickler, im Sinne von Benutzerschnittstelleübereinstimmung und Codeklarheit und -wiederverwendung erhältlich ist. Wo möglich beruhen CESE auf erhältlichen Java-API (z.B. Java2D, JavaBeans, JAXP) um den Code zu vereinfachen.

Vorbildliche Kreation erfordert einige organisatorische Aufgaben, codiertes �, das diese ODE-Integratoren, enthalten Programme für das Handhaben der vorbildlichen Parameter zu sein, das Sparen/vorbildlichen Zustand, sichtbar machensimulationsresultate, usw. CESE zurückstellend versieht Sie mit Umsetzung für diese Programme, folglich können Sie auf das Schreiben des Codes für konkretes Ionenbargeld konzentrieren, und CESE handhabt den Rest.

CESE versucht nicht, schwierige programmierenrahmen auf seinem eigenen � eher zu erstellen, es verwendet Kern Java-API. Z.B. sind Baumuster Java-Teile in Übereinstimmung mit der JavaBeans Bedingung. Wir verwenden XML, um das Festklemmen von Befehlen zu spezifizieren, und Java-Nachrichtenperiodische veröffentlichung zu sparen/vorbildliche Parameter der Wiederherstellung.

Was in diesem Auslösen neu ist:

· Dieses Auslösen verbessert Resultate Drucken, addiert Export den ersteigbaren vektorgraphiken (SVG) formatiert, verbessert Träger für kontinuierliche Simulationen und repariert viele Marken in der Plan-Wiedergabe und in der Baumusterschaltung.